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Aursus
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生物医学工程 | EEG分析 - 预处理
发表于2023-12-03|生物医学工程EEG分析|专业
Organize Data|整理数据 将导入的数据清洗为需要的结构,如选择数据类型(Matlab中有cell类型、多维度矩阵类型、structure类型等;Python中有元组tuple、列表list、字典dict、np.array、MNE数据结构等) 了解数据集的基本情况,有多少个channel,多少个病人,每个数据集存的都是什么,数据集有多大等等 Re-reference|选择参考电极 网上获取或者EEG机器获取的通常是reference free的,因此我们需要re-reference。当然也可能EEG机器输出的时候就进行了硬件层面的reference。 论文中经常看到的EEG Montage指的是EEG的电信号如何被re-reference。常见的reference方法有以下几种,但我们使用最多的是longitudinal bipolar(又称作double banana): 单极参考(Unipolar Reference):每个电极相对于参考电极进行测量。这种Montage常用于研究特定电极的活动或事件相关电位(ERPs)。常见的参考电极位置有mastoid双耳(下图左 ...
生物医学工程 | EEG分析 - Maltab基础
发表于2023-12-03|生物医学工程EEG分析|专业
Matlab基础 size(x):x矩阵的维度 length(x):x的所有维度中最大的长度 zeros(1,2):构建1行2列的零矩阵 ones(2,3):构建2行3列的1矩阵 eye(2):构建2x2的单位矩阵,对角线为1其余为0的矩阵 round(x):四舍五入取整 ceil(x):向上取整 floor(x):向下取整 repmat([1,2],2, 3):将[1,2]作为一个整体,扩充为2行3列,也就是[1,2,1,2,1,2; 1,2,1,2,1,2]的样子 diff(x):前向差值,即x的后一项减前一项 逻辑运算符号:>, <, ==, ~=, &&, || function 123456789% 定义函数function volume = calcVolume(r)% describeh = 1;volume = pi*(r^2)*h;return% 调用wheel = calcVolume(5) for循环 123for i = 1:size(EEG,1) filteredEEG(i,:)=filter(EEG(i,:));end 分配空间 ...
生物医学工程 | 解剖学 - 呼吸系统
发表于2023-12-03|生物医学工程解剖学|专业
呼吸系统 呼吸:机体与外界进行气体交换的过程 呼吸道:鼻,咽,喉,气管,支气管 肺:气体交换的场所 外呼吸:肺毛细血管血液与外界环境之间的气体交换过程 内呼吸:组织毛细血管中血液通过组织液与组织细胞间实现的气体交换 肺通气:肺与外界环境之间的气体交换过程 肺换气:肺与肺毛细血管中血液之间的气体交换过程 气体运输:循环血液将O2O_2O2​从肺运输到全身组织、细胞以及将CO2CO_2CO2​从细胞运输到肺的过程。 鼻前庭:过滤空气的第一道屏障 固有鼻腔:分为上中下三个鼻甲。嗅区(上鼻甲),呼吸区(嗅区以外的部分,由上皮细胞,血管,腺泡组成,湿润净化温暖空气) 鼻旁窦:鼻腔周围含有空气的骨腔隙 声带:声襞以及由其覆盖的声韧带和声带肌三者组成的结构 黏液屏障:杯状细胞和气管腺的分泌物共同形成 细支气管:肺叶支气管-细支气管/终末细支气管-呼吸性细支气管-肺泡/肺泡管/肺泡囊 肺小叶:肺内细支气管及其所属的肺组织。是构成肺的基本结构和功能单位 肺的功能:气体交换,呼吸通道 功能血管:肺动、静脉及其毛细血管。进行气体交换 营养血管:支气管动、静脉及其毛细血管。为肺内各级支气管提供氧气和营养物质 ...
生物医学工程 | EEG分析 - 卷积和点成
发表于2023-03-13|生物医学工程EEG分析|专业
点乘|Dot Product 数学定义 假设输入为两个vector,x=[x1,x2,...,xn]x = [x_1, x_2, ..., x_n]x=[x1​,x2​,...,xn​],y=[y1,y2,...,yn]y = [y_1, y_2, ..., y_n]y=[y1​,y2​,...,yn​],则点乘结果为 x⋅y=∑i=1nxiyi=x1y1+x2y2+...+xnynx \cdot y = \sum_{i=1}^n x_i y_i = x_1y_1+x_2y_2+...+x_ny_n x⋅y=i=1∑n​xi​yi​=x1​y1​+x2​y2​+...+xn​yn​ 代码 MATLAB代码 12z = dot(x,y)z = x * y' Python代码 1z = np.dot(x, y) 卷积|Convolution 数学定义 离散卷积定义 假设输入为两个vector,x=[x1,x2,...,xn]x = [x_1, x_2, ..., x_n]x=[x1​,x2​,...,xn​],h=[h1,h2,...,hn]h = [h_1, h_2, ..., ...
生物医学工程 | EEG分析 - 简介
发表于2023-02-03|生物医学工程EEG分析|专业
Neural Time Series Data类型 EEG(electroencephalogram)通过电场变换测量 scalp EEG:非入侵式的,类似在脑袋上面带个帽子 iEEG|intracranial EEG:开颅的,入侵式的 stereotactic EEG / depth electrode:嵌入大脑组织,深入大脑 ECoG|electrocorticogram:在大脑皮层(cortex)表面的 MEG|magnetoencephalogram:通过磁场变化测量 fMRI/PET:通过血流变化测量,通常使用BLOD LFP|local field potential spike|single unit EEG的特点 优缺点 优点 EEG时间分辨率高,尤其适合研究Cognitive, perceptual, linguistic, emotional, 和motor processes 这些发生速度超快的神经活动。 EEG或者MEG可以直接反应大脑皮层的神经活动 可以测得多维度数据:时间,空间等等 缺点 EEG不适合研究深入大脑的部分 EEG不适合研 ...
生物医学工程 | 解剖学 - 循环系统
发表于2023-01-23|生物医学工程解剖学|专业
体液分布与内环境稳态、血液成分与功能 体液:分为细胞内液和细胞外液 内环境:细胞外液 血液成分:血浆+血细胞(红细胞+白细胞+血小板) 血液功能:运输,防御和保护功能,维持稳态 血液 血浆 血浆蛋白:清蛋白(维持血液胶体渗透压),球蛋白,纤维蛋白原(参与凝血) 非蛋白氮:血浆中除了蛋白质外的含氮物质所含的氮。由肾排除 血浆渗透压=血浆晶体渗透压+血浆胶体渗透压 血浆晶体渗透压 血浆胶体渗透压 主要 小部分 晶体物质形成 血浆蛋白形成 维持细胞水平衡 维持血管水平衡 ph:偏碱性。靠缓冲对维持酸碱性 最重要的缓冲对:NaHCO3NaHCO_3NaHCO3​/H2CO3H_2CO_3H2​CO3​ 红细胞 形态:无细胞核,无细胞器,中央双凹的圆盘形 生理特性:可塑变形性,悬浮稳定性(血细胞能稳定悬浮于血浆中),渗透脆性(低渗溶液中吸水膨胀破裂) 生成原料:血红蛋白(铁和蛋白质) 成熟因子:叶酸和维生素B12B_{12}B12​ 促红素:促进红细胞的增值和分化。(促进红细胞生成素和爆式促进因子) 寿命:约120天。 破坏:破损溶血(血管内),被巨噬细胞吞噬(血管 ...
生物医学工程 | 解剖学 - 运动系统
发表于2023-01-02|生物医学工程解剖学|专业
运动系统的基本介绍 运动系统组成、骨骼、关节、脊椎骨 运动系统的组成:骨、骨连接、骨骼肌 骨骼功能:赋予人体基本形态、支持体重、保护人体内部重要器官 骨的数量:共206块 骨的分类:长骨、短骨、扁骨、不规则骨 骨的构造:骨膜(营养作用)、骨质、骨髓 骨的化学成分:有机质(弹性)+无机质(硬度),随年龄变化 骨生长发育的类别:膜化骨、软骨化骨 初级与次级骨化中心:初级骨化中心(先出现,在骨骼中央),次级骨化中心(后出现,在骨两端) 骨连接的概念:骨与骨之间的连接 骨连接分类:直接连接(用致密结缔组织膜、软骨、骨组织——活动幅度小)、间接连接(关节——全身骨主要的连接形式,活动幅度大) 关节的基本构造:关节面、关节囊(内外两层,外:纤维层,固着作用;内:滑膜层,润滑、减少摩擦)、关节腔(腔内负压,有助于关节的稳固) 关节的辅助结构:韧带(增加稳固性)、关节盘(缓冲外力,增加稳固性和灵活性)、关节唇(增大关节面) 脊椎骨数量:颈椎7、胸椎12、腰椎5、骶骨1、尾骨1 脊柱生理弯曲:4个。颈曲、胸曲、腰曲、骶曲。作用:增大胸腔和盆腔容积,重心后移,有利于保持直立,减少运动对脑的震荡 骨盆:髋骨 ...
笔记 | 急救知识
发表于2022-12-23
心肺复苏 温馨提示:基本做出来都会带点内伤,压断肋骨啥的挺常见的。 !确认周围环境安全 !判断有无意识。拍拍肩膀拍拍脸,呼叫一下看是否还有意识 !找人打急救电话,看有无AED !检查脉搏呼吸。先感受一下劲动脉跳没跳;看一下胸口有无起伏;感受一下还有无呼吸。如果还有呼吸脉搏就蹲那看着等救护车就好了。没有的话再开始心肺复苏 找个平地,人放平,脑袋后面不要垫东西。衣服尽量脱干净(尬住但必要) 在两乳正中间的位置,一只手张开放在胸口,另外一只手压在上面扣住下面的手 手臂伸直,垂直下压。频率基本就是“01”“02”“03”这样接着数数 !30次停下来,开放气道 检查口鼻内有无异物,有的话就扣出来 压额抬下巴法:使得下巴、耳垂的连线与地面垂直。 人工呼吸:捏住患者鼻子,正常呼吸然后将气吐到患者嘴巴里(有一说一,理论上应该是嘴包住嘴,虽然不太对劲但是确实理论上是这样的) 然后松开鼻子,缓2s再继续一次 比例:30:2(按压:人工呼吸) AED 温馨提示:有AED优先使用AED。 按照指示将电片贴在皮肤上(不要隔着衣服),确认周围没人触碰患者后,按下放电按钮 如果人没醒就先做心肺复苏,然后等充电 ...
生物医学工程 | 解剖学 - 绪论
发表于2022-12-03|生物医学工程解剖学|专业
解剖和生理学定义 解剖:研究正常人体各器官、系统的形态结构和发生规律的科学 生理:研究正常人体各器官、系统的功能、机制、原理、调节规律的科学 解剖学分类 大体解剖学+组织解剖学 生理学研究水平 整体水平 器官和系统水平 细胞和分子水平 解剖学基本研究方法 经典方法:手术器械解剖尸体,肉眼观察比较 器官层面:X射线、CT、PET、FMRI 组织和细胞层面:光学显微镜、电子显微镜、激光扫描共聚焦显微镜 分子层面:分子生物学、免疫细胞化学 动物实验方法分类 在体实验、离体实验(急性—麻醉、慢性—清醒) 标准解剖学姿势 人体直立、双臂自然下垂、掌心向前、双足并拢、足尖向前、双目向前方平视 常用解剖学术语 方位术语:上下(颅顶足底)、前后(腹背)、内外(近内腔)、浅深(近皮肤) 轴:垂直轴(上下)、矢状轴(前后)、冠状轴(左右) 面:垂直面(分成前后)、矢状面(分成上下)、冠状面(分成前后) 声明:此blog内容为上课笔记,仅为分享使用。部分图片和内容取材于课本、老师课件、网络。如果有侵权,请联系aursus.blog@gmail.com删除。
编程 | Markdown
发表于2022-07-08|编程
基本语法模板 Markdown 标题 123# 一级标题## 二级标题### 三级标题 Markdown 列表 12- 列表项目1. 列表项目 列表项目 列表项目 Markdown 字体 1234*斜体* 或 _斜体_**粗体*****加粗斜体***~~删除线~~ 斜体或 斜体 粗体 加粗斜体 删除线 Markdown 插入链接 1[链接文字](链接网址 "标题") Markdown 插入图片 1![alt text](/path/to/img.jpg "Title") Markdown 行内代码 1`行内代码` 行内代码 Markdown 插入代码块 123```python#!/usr/bin/python3print("Hello, World!"); 1234```python#!/usr/bin/python3print("Hello, World!"); Markdown 引用 1> 引用内容 引用内容 Markdown 分割线 1--- Markdown 段首缩进 1234 ...
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