Neural Time Series Data类型

EEG(electroencephalogram)通过电场变换测量

scalp EEG:非入侵式的,类似在脑袋上面带个帽子

iEEG|intracranial EEG:开颅的,入侵式的

stereotactic EEG / depth electrode:嵌入大脑组织,深入大脑

ECoG|electrocorticogram:在大脑皮层(cortex)表面的

MEG|magnetoencephalogram:通过磁场变化测量

fMRI/PET:通过血流变化测量,通常使用BLOD

LFP|local field potential

spike|single unit

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EEG的特点

优缺点

优点

  1. EEG时间分辨率高,尤其适合研究Cognitive, perceptual, linguistic, emotional, 和motor processes 这些发生速度超快的神经活动。
  2. EEG或者MEG可以直接反应大脑皮层的神经活动
  3. 可以测得多维度数据:时间,空间等等

缺点

  1. EEG不适合研究深入大脑的部分
  2. EEG不适合研究需要定位准确的研究
  3. EEG不适合需要极高时间精度的研究,因为每秒钟大脑状态都不太一样

检测60Hz以上的高频活动,用MEG比用EEG更好

单位

通常EEG的单位是volt,一般是mVmV或者μV\mu V

通常MEG的单位是tesla,一般是fT,也就是101510^{-15}

Oscillation in EEG

名称 频率范围(Hz) 位置 备注
Delta <4 - Non-REM sleep - 儿童 - continuous- attention tasks
Theta 4-8 - 幼儿常见 - 成年人和青少年昏昏欲睡drownsiness或者怠工idling的时候 - 尝试压制本能反应时 - 第一阶段睡眠
Alpha 8-12 - 放松的时候 - 闭着眼睛的时候 - 大脑不同区域远距离通讯
Mu (SMR) 8-13 - 又叫做sensorimotor rhythm (SMR) - 自闭症autism - rest-state motor neurons
Sigma 12-16 - Non-REM sleep → memory consolidation
Beta 15-30 - 思维活跃的时候:如注意力集中,高度警惕,焦虑不安
Low Gamma 30-80 - 多感知multi-sensory,意识 - 短时间记忆
High Gamma 80-150 - emotion
Ripples 80-250 - 属于HFO(high- frequency oscillations) - 多和疾病有关,如癫痫
Fast Ripples 250-500 - 属于HFO(high- frequency oscillations) - 多和疾病有关,如癫痫

注意:貌似学术界对不同类型的freq范围没有统一的规定,不同的文献说法各不相同

ERP vs Time-Frequency Based Approach

ERP

ERP是"Event-Related Potentials"(事件相关电位)的缩写

ERP通过将多个重复事件的EEG信号取平均,以消除与事件无关的噪声。最典型的案例是P300,即人脑看到令他惊讶的事情后300ms的时候会产生一个正向的波

需要注意的是,time-locked 但non-phase-locked的活动在经过ERP平均之后会导致信息丢失。如下图所示:第二列通过ERP求平均得到的幅度值会由于不同trial正负叠加而逐渐消失,但是如果计算power得到的则可以明显的观察到频率的增长

Time-Frequency Based Approach

Time-Frequency Based Approach通常可以帮助我们获得关于oscillation的信息

Topographical Localization

Topographical通常显示了电极的位置,如下图

图片名称

10-20 system

10-20 system是EEG电极摆放位置的国际标准。10,20指的是相邻电极之间的距离是颅骨前后或左右总距离的 10% 或 20%,参考下图

电极的数量(也称为通道数channel number)有16、32、64、128等。医疗上一般优先选择32通道,因为32通道是能够可靠定位信号源的最少通道数,而电极数目多了会增加成本和噪声干扰等。

10-20的概念示意图

电极摆放位置示意图

Time-frequency Result

A)频率切片:以频率为横坐标,纵坐标可以为功率等等B)时间切片:以时间为横坐标,纵坐标可以为功率等等C)空间切片:以空间x和y为横纵坐标,用topography 的颜色深浅来表示第三坐标,反应power等参数的大小D)频率-时间:以时间为横坐标,以频率为纵坐标,用topography 的颜色深浅来表示第三坐标, 反应power等参数的大小


优秀的参考材料

《Analyzing Neural Time Series Data》

cohen的课程录屏:https://mikexcohen.com/lectures.html

cohen课本的matlab代码:https://github.com/mikexcohen/AnalyzingNeuralTimeSeries

cohen课本的python代码翻译:https://github.com/lyndond/Analyzing_Neural_Time_Series/tree/master/notebooks

《Neural Data Science》基于python:https://neuraldatascience.io/intro.html

其他推荐的一些参考书:https://zhuanlan.zhihu.com/p/521485505


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