生物医学工程 | EEG分析 - 简介
Neural Time Series Data类型
EEG(electroencephalogram)通过电场变换测量
scalp EEG:非入侵式的,类似在脑袋上面带个帽子
iEEG|intracranial EEG:开颅的,入侵式的
stereotactic EEG / depth electrode:嵌入大脑组织,深入大脑
ECoG|electrocorticogram:在大脑皮层(cortex)表面的
MEG|magnetoencephalogram:通过磁场变化测量
fMRI/PET:通过血流变化测量,通常使用BLOD
LFP|local field potential
spike|single unit
EEG的特点
优缺点
优点
- EEG时间分辨率高,尤其适合研究Cognitive, perceptual, linguistic, emotional, 和motor processes 这些发生速度超快的神经活动。
- EEG或者MEG可以直接反应大脑皮层的神经活动
- 可以测得多维度数据:时间,空间等等
缺点
- EEG不适合研究深入大脑的部分
- EEG不适合研究需要定位准确的研究
- EEG不适合需要极高时间精度的研究,因为每秒钟大脑状态都不太一样
检测60Hz以上的高频活动,用MEG比用EEG更好
单位
通常EEG的单位是volt,一般是或者。
通常MEG的单位是tesla,一般是fT,也就是
Oscillation in EEG
名称 | 频率范围(Hz) | 位置 | 备注 |
---|---|---|---|
Delta | <4 | - Non-REM sleep - 儿童 - continuous- attention tasks | |
Theta | 4-8 | - 幼儿常见 - 成年人和青少年昏昏欲睡drownsiness或者怠工idling的时候 - 尝试压制本能反应时 - 第一阶段睡眠 | |
Alpha | 8-12 | - 放松的时候 - 闭着眼睛的时候 - 大脑不同区域远距离通讯 | |
Mu (SMR) | 8-13 | - 又叫做sensorimotor rhythm (SMR) - 自闭症autism - rest-state motor neurons | |
Sigma | 12-16 | - Non-REM sleep → memory consolidation | |
Beta | 15-30 | - 思维活跃的时候:如注意力集中,高度警惕,焦虑不安 | |
Low Gamma | 30-80 | - 多感知multi-sensory,意识 - 短时间记忆 | |
High Gamma | 80-150 | - emotion | |
Ripples | 80-250 | - 属于HFO(high- frequency oscillations) - 多和疾病有关,如癫痫 | |
Fast Ripples | 250-500 | - 属于HFO(high- frequency oscillations) - 多和疾病有关,如癫痫 |
注意:貌似学术界对不同类型的freq范围没有统一的规定,不同的文献说法各不相同
ERP vs Time-Frequency Based Approach
ERP
ERP是"Event-Related Potentials"(事件相关电位)的缩写
ERP通过将多个重复事件的EEG信号取平均,以消除与事件无关的噪声。最典型的案例是P300,即人脑看到令他惊讶的事情后300ms的时候会产生一个正向的波
需要注意的是,time-locked 但non-phase-locked的活动在经过ERP平均之后会导致信息丢失。如下图所示:第二列通过ERP求平均得到的幅度值会由于不同trial正负叠加而逐渐消失,但是如果计算power得到的则可以明显的观察到频率的增长
Time-Frequency Based Approach
Time-Frequency Based Approach通常可以帮助我们获得关于oscillation的信息
Topographical Localization
Topographical通常显示了电极的位置,如下图
10-20 system
10-20 system是EEG电极摆放位置的国际标准。10,20指的是相邻电极之间的距离是颅骨前后或左右总距离的 10% 或 20%,参考下图
电极的数量(也称为通道数channel number)有16、32、64、128等。医疗上一般优先选择32通道,因为32通道是能够可靠定位信号源的最少通道数,而电极数目多了会增加成本和噪声干扰等。
Time-frequency Result
优秀的参考材料
《Analyzing Neural Time Series Data》
cohen的课程录屏:https://mikexcohen.com/lectures.html
cohen课本的matlab代码:https://github.com/mikexcohen/AnalyzingNeuralTimeSeries
cohen课本的python代码翻译:https://github.com/lyndond/Analyzing_Neural_Time_Series/tree/master/notebooks
《Neural Data Science》基于python:https://neuraldatascience.io/intro.html
其他推荐的一些参考书:https://zhuanlan.zhihu.com/p/521485505
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